Metadata-Version: 2.1
Name: bam-shot
Version: 0.0.1
Summary: A tools of bam to image
Home-page: UNKNOWN
Author: Ying Zhu
Author-email: win19890412@163.com
License: UNKNOWN
Platform: UNKNOWN
Classifier: Programming Language :: Python :: 3
Classifier: License :: OSI Approved :: MIT License
Classifier: Operating System :: OS Independent
License-File: LICENSE
Requires-Dist: pysam

# BAM shot

该包用于对BAM文件画图，依赖samtools, python3.X, pyssam版本： 主要参数:

- bam: BAM文件
- ref: 参考基因组FASTA，需要提前使用samtools faidx构建索引
- chrom: 染色体
- start: 起始位置
- end：终止位置
- extend：两端拓展长度
- ……

