README.rst
setup.py
bio_pype.egg-info/PKG-INFO
bio_pype.egg-info/SOURCES.txt
bio_pype.egg-info/dependency_links.txt
bio_pype.egg-info/entry_points.txt
bio_pype.egg-info/requires.txt
bio_pype.egg-info/top_level.txt
pype/__config__.py
pype/__init__.py
pype/__version__.py
pype/binfmisc.py
pype/commands.py
pype/env_modules.py
pype/logger.py
pype/misc.py
pype/repos.yaml
pype/modules/__init__.py
pype/modules/pipelines.py
pype/modules/profiles.py
pype/modules/repos.py
pype/modules/snippets.py
pype/pipelines/__init__.py
pype/profiles/__init__.py
pype/queues/__init__.py
pype/snippets/__init__.py
pype/utils/__init__.py
pype/utils/arguments.py
pype/utils/pipeline.py
pype/utils/profiles.py
pype/utils/queues.py
test/test_logger.py
test/test_misc.py
test/test_pipelines.py
test/test_profiles.py
test/test_snippets.py