vol_gaussian_psf — 3D restoration op

데이터 종류: measurementvoxel

호출: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_gaussian_psf(sigma, truncate=4.0)(구현을 직접 호출하려면 import volrestore; volrestore.vol_gaussian_psf(sigma, truncate=4.0), 원장에서 가져오려면 ops3d.get("vol_gaussian_psf"))

사용법

총합 1 로 정규화한 3-D 가우스 PSF 커널. *sigma* 는 스칼라 또는 축별.

> 아래 상세 설명은 원문입니다 —— 요약과 제목은 번역되어 있습니다.

`(sz, sy, sx) in voxels; the kernel spans +-truncate*sigma` per axis

(odd size, centre at the middle voxel). The convenient companion to

:func:vol_richardson_lucy when the instrument PSF is well approximated

as Gaussian. Kernels above `PSF_MAX_ELEMENTS` (~256^3) raise

`ValueError` — a PSF that large is an input mistake, not an instrument.

形: 各軸の半径 `r = ceil(truncate * sigma)、辺長 2r + 1`(奇数)の

`(2rz+1, 2ry+1, 2rx+1) float64 配列。軸順は (z, y, x) で、sigma` を

`(sz, sy, sx)` で渡すとその順に対応する(異方 PSF)。3 本の 1-D Gaussian

`exp(-x^2 / (2 sigma^2))` の外積を全体和で割るので、合計はちょうど 1、中心

voxel が最大値。単位は voxel(mm の PSF 幅は spacing で割ってから渡す)。

引数と検証(`ValueError`):

• `sigma`: 正の有限スカラ、または長さ 3 の正の有限値。2 乗が 0 に

アンダーフローするほど小さい値(~1.5e-154 未満)は 0/0 になるので拒否。

• `truncate`: 正の有限値(既定 4.0 = 片側 4σ で打ち切り)。

• 要素数 `prod(2r+1)PSF_MAX_ELEMENTS(2**24`)を超えると拒否

(σ≈300 で 64 GB を確保しかけた実測が動機)。

使いどころ: `vol_richardson_lucy(vol, psf)psf`。RL 側でも合計 1 に

再正規化するので、ここで作ったカーネルをそのまま渡してよい。

참고(샘플 데이터·문헌)

• 샘플 데이터 카탈로그(DL URL / 라이선스) —— 2-D 는 skimage.data(BSD/public)+ 합성, 3-D 는 실데이터 소스(Stanford/PDS 등)의 DL URL.

• 연산자의 내력·참고문헌 —— 이 연산자 족의 바탕이 된 연구/기법의 출처.

실행 가능한 예제(이 연산자를 실제로 호출하는 검증된 샘플)

deconv_fft_restorepy -3.11 examples_3d/deconv_fft_restore.py

타입이 이어지는 다음 연산자(voxel 를 입력으로 받는 것)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

같은 카테고리(restoration)

vol_richardson_lucy


*Provenance: volrestore.py — 3D 연산자 레지스트리. 이 op 노트는 tools/opdocs.py md 가 자동 생성합니다(직접 편집하지 마세요).*

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