vol_distance_transform — 3D medial op

• データ種: voxel → voxel

• 呼び出し: import fullseye as fs; fs.ledger.vol_distance_transform(vol_binary, spacing=None) (実装を直接呼ぶなら import volops; volops.vol_distance_transform(vol_binary, spacing=None)、台帳から引くなら ops3d.get("vol_distance_transform"))

使い方

二値ボリュームの厳密ユークリッド距離変換。

> 以下の詳細説明は原文のままです —— 要約と見出しは訳出済み。

Each foreground (non-zero) voxel is labelled with its Euclidean distance to

the nearest background voxel, via `scipy.ndimage.distance_transform_edt`.

Pass *spacing* `(sz, sy, sx) (e.g. VolumeMeta.spacing_mm`, or the

`VolumeMeta` itself) to make the distance anisotropy-aware — millimetres

rather than voxels; otherwise unit spacing is assumed. A non-`{0, 1}` input

is thresholded at `> 0.5`.

Returns a `(D, H, W)` float64 distance field (0 on the background).

Reference: Felzenszwalb & Huttenlocher, Theory of Computing 2012.

参考(サンプルデータ・文献)

• サンプルデータ カタログ(DL URL / ライセンス) — 2-D は skimage.data(BSD/public)+ 合成、3-D は実データ源(Stanford/PDS 等)の DL URL。

• 演算子の来歴・参考文献 — この op 族の元になった研究/手法の出典。

実行できる例(この op を実際に呼ぶ検証済みサンプル)

• medial_topology — py -3.11 examples_3d/medial_topology.py

• molecule_atom_count — py -3.11 examples_3d/molecule_atom_count.py

• vessel_metrology — py -3.11 examples_3d/vessel_metrology.py

型が繋がる次の op(voxel を入力に取れる)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

同カテゴリ(medial)

distance_ridge · skeletonize_vol · medial_axis_points · topology_signature · medial_match · skeleton_junctions3d · skeleton_endpoints3d · skeleton_prune3d

*Provenance: volops.py — 3D operator registry. この per-op ノートは tools/opdocs.py md が自動生成(手編集しない)。*

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