skeletonize_vol — 3D medial op

数据种类:voxelvoxel

调用: import fullseye as fs; fs.ledger.skeletonize_vol(vol)(要直接调用实现,import medial; medial.skeletonize_vol(vol);从台账取用则 ops3d.get("skeletonize_vol"))

用法

把 3D 二值 voxel 细化为 1 voxel 宽的骨架。skimage 的 Lee(1994)法封装。

> 以下的详细说明为原文 —— 摘要与标题已翻译。

method='lee' は 3D 対応の位相保存細線化。塊も含めて線状の骨格へ潰す(medial *surface* が

欲しい場合は distance_ridge を使う)。返り値は入力と同形の bool 配列。

Args:

vol: バイナリ voxel(bool / 0-1 の 3D)。

Returns:

skeleton (bool 3D): 骨格 voxel。

入力の扱い: `_as_binary_volume` が 3-D 配列を bool に正規化する(非ゼロ = 前景)。

3-D でない・空配列・float で NaN/Inf を含む場合は `ValueError`。軸順は

`(z, y, x)`、距離・太さは voxel 単位で、等方サンプリングを仮定する(異方

voxel のままだと細線化の結果が軸ごとに偏る。先に `vol_resize` で等方化する)。

挙動:

• 前景が無ければ全 False の同形配列を返す(skimage は呼ばない)。

• `skimage.morphology.skeletonize(mask, method="lee")` は遅延 import。

scikit-image が無い環境ではここで `ImportError` になる。

• Lee 法は位相を保つ(連結成分数・穴・空洞を変えない)が、太い塊は複数の枝に

潰れ、表面の凹凸に応じたヒゲ(短い枝)が出る。ヒゲは `skeleton_prune3d` で

刈る。

使いどころ: `topology_signature(端点・分岐の数)、skeleton_junctions3d` /

`skeleton_endpoints3d / skeleton_branches3d` の入力。骨格 voxel の局所

半径が要るなら `distance_ridgeedt` を骨格位置で引く。

参考(示例数据・文献)

• 示例数据目录(下载 URL / 许可证) —— 2-D 用 skimage.data(BSD/公有领域)加合成图,3-D 给出真实数据源(Stanford/PDS 等)的下载 URL。

• 算子来历与参考文献 —— 该算子族所依据的研究/方法出处。

可运行的示例(实际调用该算子并已验证的样例)

medial_topologypy -3.11 examples_3d/medial_topology.py

类型可衔接的下一个算子(可接受 voxel 作为输入)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

同类别(medial)

distance_ridge · medial_axis_points · topology_signature · medial_match · skeleton_junctions3d · skeleton_endpoints3d · skeleton_prune3d · skeleton_branches3d


*Provenance: medial.py — 3D 算子登记表。本条目由 tools/opdocs.py md 自动生成(请勿手工编辑)。*

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