skeleton_junctions3d — 3D `medial` op

• Datenarten: voxel → voxel

• Aufruf: import fullseye as fs; fs.ledger.skeleton_junctions3d(vol) (die Implementierung direkt: import medial; medial.skeleton_junctions3d(vol); aus dem Register: ops3d.get("skeleton_junctions3d"))

Verwendung

Liefert die Knoten eines 3-D-Skeletts (drei oder mehr Skelettvoxel in der 26er-Nachbarschaft) als Voxelmaske.

> Die ausführliche Beschreibung unten ist der Originaltext — Zusammenfassung und Überschriften sind übersetzt.

骨格でない入力(interior を持つ塊)は skeletonize_vol で細線化してから測る。

2D の junctions_skeleton の 3D 版。血管・多孔質・ネットワーク状構造の

グラフ化(node 抽出)に使う。分岐次数の集計だけ欲しい場合は

topology_signature が dict で返す。

注意(honest): 26 近傍次数は分岐近傍の対角隣接で過大に出うる(離散骨格の

既知の性質)。分岐 *個数* を数えるときはこのマスクを連結成分でまとめること。

手順: `_ensure_skeleton` — 入力を bool 化し、6 近傍(面隣接)がすべて前景の

interior voxel が 1 つでもあれば「骨格ではない」とみなして `skeletonize_vol`

(skimage Lee 法)を先に掛ける。その後、3x3x3 の全 1 カーネル(中心 0)の畳み込み

(`mode="constant"`、外側は 0)で各 voxel の 26 近傍にある骨格 voxel 数(次数)を

数え、`skel & (次数 >= 3)` を返す。

返り値: 入力と同形の bool 配列。前景が無ければ全 False。骨格 voxel 以外は

必ず False。座標は `np.argwhere で (z, y, x)` 順に取れる。

検証(`ValueError`): 3-D でない・空配列・float で NaN/Inf を含む入力。

scikit-image が無い環境で細線化が必要になると `ImportError`。

注意: 既に骨格の入力でも interior 判定は毎回走る(細い骨格なら細線化は

skip される)。個数を数えるなら `vol_label(mask, 26)` の成分数を使う。

枝に分けるのは `skeleton_branches3d、端点は skeleton_endpoints3d`。

Referenzen (Beispieldaten, Literatur)

• Katalog der Beispieldaten (Download-URLs / Lizenzen) — 2-D nutzt skimage.data (BSD/Public Domain) plus synthetische Bilder, 3-D nennt Download-URLs echter Datenquellen (Stanford, PDS, …).

• Herkunft und Literatur der Operatoren — die Quellen der Forschung/Verfahren, auf denen diese Operatorfamilie beruht.

Ausführbare Beispiele (verifizierte Samples, die diesen Operator wirklich aufrufen)

• medial_topology — py -3.11 examples_3d/medial_topology.py

Typkompatible Folge-Operatoren (nehmen `voxel` als Eingabe)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

Gleiche Kategorie (`medial`)

distance_ridge · skeletonize_vol · medial_axis_points · topology_signature · medial_match · skeleton_endpoints3d · skeleton_prune3d · skeleton_branches3d

*Provenance: medial.py — 3D Operator-Registry. Diese Notiz wird von tools/opdocs.py md erzeugt (nicht von Hand bearbeiten).*

skeleton_junctions3d — 3D medial op