skeleton_endpoints3d — 3D medial op

数据种类:voxelvoxel

调用: import fullseye as fs; fs.ledger.skeleton_endpoints3d(vol)(要直接调用实现,import medial; medial.skeleton_endpoints3d(vol);从台账取用则 ops3d.get("skeleton_endpoints3d"))

用法

以体素掩码返回 3D 骨架的端点(26 邻域中骨架 voxel 不超过 1 个)。

> 以下的详细说明为原文 —— 摘要与标题已翻译。

孤立 voxel(次数 0)も端点に数える。2D の r2_endpoints_skeleton の 3D 版。

手順: `_ensure_skeleton` で入力を bool 化し、6 近傍がすべて前景の interior voxel

があれば `skeletonize_vol` で細線化してから、3x3x3 全 1 カーネル(中心 0、

`mode="constant"` で外側 0)の畳み込みで各 voxel の 26 近傍にある骨格 voxel 数

(次数)を数え、`skel & (次数 <= 1)` を返す。volume の縁にある骨格 voxel は、

外側が 0 扱いなので枝がそこで途切れていれば端点になる。

返り値: 入力と同形の bool 配列(端点 = True)。前景が無ければ全 False。

`np.argwhere(z, y, x) 座標に、.sum()` で端点数になる。

検証(`ValueError`): 3-D でない・空配列・float で NaN/Inf を含む入力。

細線化が必要で scikit-image が無い環境では `ImportError`。

注意:

• 端点は各枝の末端で厳密だが、ヒゲ(細線化が作る短い枝)の先端も端点に数える。

構造の端だけ欲しければ先に `skeleton_prune3d` で刈る。

• 閉ループだけの骨格(輪)は端点 0 個。

• 数だけ欲しいなら `topology_signatureendpoints / isolated` を

分けて返す。

参考(示例数据・文献)

• 示例数据目录(下载 URL / 许可证) —— 2-D 用 skimage.data(BSD/公有领域)加合成图,3-D 给出真实数据源(Stanford/PDS 等)的下载 URL。

• 算子来历与参考文献 —— 该算子族所依据的研究/方法出处。

可运行的示例(实际调用该算子并已验证的样例)

medial_topologypy -3.11 examples_3d/medial_topology.py

类型可衔接的下一个算子(可接受 voxel 作为输入)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

同类别(medial)

distance_ridge · skeletonize_vol · medial_axis_points · topology_signature · medial_match · skeleton_junctions3d · skeleton_prune3d · skeleton_branches3d


*Provenance: medial.py — 3D 算子登记表。本条目由 tools/opdocs.py md 自动生成(请勿手工编辑)。*

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