skeleton_endpoints3d — 3D `medial` op

• Datenarten: voxel → voxel

• Aufruf: import fullseye as fs; fs.ledger.skeleton_endpoints3d(vol) (die Implementierung direkt: import medial; medial.skeleton_endpoints3d(vol); aus dem Register: ops3d.get("skeleton_endpoints3d"))

Verwendung

Liefert die Endpunkte eines 3-D-Skeletts (höchstens ein Skelettvoxel in der 26er-Nachbarschaft) als Voxelmaske.

> Die ausführliche Beschreibung unten ist der Originaltext — Zusammenfassung und Überschriften sind übersetzt.

孤立 voxel(次数 0)も端点に数える。2D の r2_endpoints_skeleton の 3D 版。

手順: `_ensure_skeleton` で入力を bool 化し、6 近傍がすべて前景の interior voxel

があれば `skeletonize_vol` で細線化してから、3x3x3 全 1 カーネル(中心 0、

`mode="constant"` で外側 0)の畳み込みで各 voxel の 26 近傍にある骨格 voxel 数

(次数)を数え、`skel & (次数 <= 1)` を返す。volume の縁にある骨格 voxel は、

外側が 0 扱いなので枝がそこで途切れていれば端点になる。

返り値: 入力と同形の bool 配列(端点 = True)。前景が無ければ全 False。

`np.argwhere で (z, y, x) 座標に、.sum()` で端点数になる。

検証(`ValueError`): 3-D でない・空配列・float で NaN/Inf を含む入力。

細線化が必要で scikit-image が無い環境では `ImportError`。

注意:

• 端点は各枝の末端で厳密だが、ヒゲ(細線化が作る短い枝)の先端も端点に数える。

構造の端だけ欲しければ先に `skeleton_prune3d` で刈る。

• 閉ループだけの骨格(輪)は端点 0 個。

• 数だけ欲しいなら `topology_signature が endpoints / isolated` を

分けて返す。

Referenzen (Beispieldaten, Literatur)

• Katalog der Beispieldaten (Download-URLs / Lizenzen) — 2-D nutzt skimage.data (BSD/Public Domain) plus synthetische Bilder, 3-D nennt Download-URLs echter Datenquellen (Stanford, PDS, …).

• Herkunft und Literatur der Operatoren — die Quellen der Forschung/Verfahren, auf denen diese Operatorfamilie beruht.

Ausführbare Beispiele (verifizierte Samples, die diesen Operator wirklich aufrufen)

• medial_topology — py -3.11 examples_3d/medial_topology.py

Typkompatible Folge-Operatoren (nehmen `voxel` als Eingabe)

voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa

Gleiche Kategorie (`medial`)

distance_ridge · skeletonize_vol · medial_axis_points · topology_signature · medial_match · skeleton_junctions3d · skeleton_prune3d · skeleton_branches3d

*Provenance: medial.py — 3D Operator-Registry. Diese Notiz wird von tools/opdocs.py md erzeugt (nicht von Hand bearbeiten).*

skeleton_endpoints3d — 3D medial op