medial op• Data kinds: voxel → voxel
• Call: import fullseye as fs; fs.ledger.skeleton_branches3d(vol, min_length=0) (to call the implementation directly, import medial; medial.skeleton_branches3d(vol, min_length=0); from the registry, ops3d.get("skeleton_branches3d"))
Cut a 3-D skeleton at its junctions into branches (segments). The 3-D version of the 2-D r2_split_skeleton_lines.
> The detailed description below is the original text — the summary and the headings are translated.
分岐点 voxel を除いた残りが枝。min_length > 0 なら、26 連結成分の voxel 数が
それ未満の断片を除去する。
手順: `_ensure_skeleton で bool 化(interior voxel があれば skeletonize_vol`
で細線化)→ 26 近傍次数 `>= 3 の voxel(分岐点)を取り除く → min_length > 0`
なら `scipy.ndimage.label`(3x3x3 全 1 構造 = 26 連結)で成分に分け、voxel 数が
`min_length` 未満の成分を落とす。
返り値: 入力と同形の bool 配列(枝 voxel = True)。枝ごとのラベルは返さない
— 枝を個別に扱うには返り値を `vol_label(branches, 26)` に通す(成分数 = 枝数)。
分岐点 voxel そのものは結果に含まれないので、枝の両端は分岐点の 1 voxel 手前で
終わる。
引数と検証: `min_length は voxel 数(int()` で切り捨て。0 なら除去しない)。
入力が 3-D でない・空・NaN/Inf は `ValueError`。細線化が必要で
scikit-image が無ければ `ImportError`。前景が無ければ全 False。
注意: 26 近傍次数は分岐の対角隣接で 3 以上になりやすく、分岐点が数 voxel の
塊として除かれるため、枝が実際より短く出ることがある。閉ループだけの骨格は
分岐点が無く、全体が 1 本の枝として残る。
• Sample-data catalog (download URLs / licences) — 2-D uses skimage.data (BSD/public domain) plus synthetic images; 3-D lists download URLs for real data sources (Stanford, PDS, …).
• Operator provenance and references — the sources of the research/methods this op family came from.
• medial_topology — py -3.11 examples_3d/medial_topology.py
voxel as input)voxel_to_mips · voxel_to_mesh · signed_distance_field · to_points · sobel3d · hessian3d · curvature_maps · edt_jfa
medial)distance_ridge · skeletonize_vol · medial_axis_points · topology_signature · medial_match · skeleton_junctions3d · skeleton_endpoints3d · skeleton_prune3d
*Provenance: medial.py — 3D operator registry. This per-op note is generated by tools/opdocs.py md (do not hand-edit).*
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