INSTALL
LICENSE
MANIFEST.in
README
setup.py
fastsemsim/__init__.py
fastsemsim/fastsemsim_cmdline.py
fastsemsim/version
fastsemsim.egg-info/PKG-INFO
fastsemsim.egg-info/SOURCES.txt
fastsemsim.egg-info/dependency_links.txt
fastsemsim.egg-info/entry_points.txt
fastsemsim.egg-info/requires.txt
fastsemsim.egg-info/top_level.txt
fastsemsim/ac/AnnotationCorpus.py
fastsemsim/ac/GAF2AnnotationCorpusParser.py
fastsemsim/ac/NCBIAnnotationCorpusParser.py
fastsemsim/ac/PlainAnnotationCorpusParser.py
fastsemsim/ac/__init__.py
fastsemsim/ac/_libs.py
fastsemsim/ac/toremove_GOAnnotationCorpus.py
fastsemsim/api/BatchSemSim.py
fastsemsim/api/__init__.py
fastsemsim/data/Dataset.py
fastsemsim/data/__init__.py
fastsemsim/data/dataset.txt
fastsemsim/data/ACs/DO_human_Osborne_BMC_2010.08.24.txt
fastsemsim/data/ACs/DO_human_Peng_NAR_2014.10.12.txt
fastsemsim/data/ACs/GO.goa_arabidopsis_2019.01.29.gz
fastsemsim/data/ACs/GO.goa_fly_2019.01.29.gz
fastsemsim/data/ACs/GO.goa_human_2019.01.29.gz
fastsemsim/data/ACs/GO.goa_mouse_2019.01.29.gz
fastsemsim/data/ACs/GO.goa_rat_2019.01.29.gz
fastsemsim/data/ACs/GO.goa_worm_2019.01.29.gz
fastsemsim/data/ACs/GO.goa_zebrafish_2019.01.29.gz
fastsemsim/data/Os/CellOntology_2014.10.13.obo
fastsemsim/data/Os/CellOntology_2019.01.29.obo
fastsemsim/data/Os/DiseaseOntology_2014.10.13.obo
fastsemsim/data/Os/DiseaseOntology_2019.01.29.obo
fastsemsim/data/Os/DiseaseOntology_2019.03.07.obo
fastsemsim/data/Os/GeneOntology_2019.01.29.obo
fastsemsim/data/Os/GeneOntology_2019.01.29.obo-xml.gz
fastsemsim/data/Os/HumanPhenotypeOntology_2019.01.29.obo
fastsemsim/data/Os/pato_2014.09.09.obo
fastsemsim/data/__pycache__/Dataset.cpython-35.pyc
fastsemsim/data/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc
fastsemsim/data/input_dataset_processing/DOA.sh
fastsemsim/data/input_dataset_processing/GOA.sh
fastsemsim/data/input_dataset_processing/Os.sh
fastsemsim/examples/.A.swp
fastsemsim/examples/.B.swp
fastsemsim/examples/README
fastsemsim/examples/__init__.py
fastsemsim/examples/calculate_ss_on_go.py
fastsemsim/examples/example_cmdline.sh
fastsemsim/examples/example_cmdline_params.txt
fastsemsim/examples/load_annotation_corpus.py
fastsemsim/examples/load_go_annotation_corpus.py
fastsemsim/examples/load_ontology.py
fastsemsim/examples/__pycache__/__init__.cpython-35.pyc
fastsemsim/examples/__pycache__/load_annotation_corpus.cpython-35.pyc
fastsemsim/examples/__pycache__/load_ontology.cpython-35.pyc
fastsemsim/examples/data/DO_list_objset_query.txt
fastsemsim/examples/data/DO_list_query.txt
fastsemsim/examples/data/GO_fly_list_query.txt
fastsemsim/examples/data/GO_fly_pairs_query.txt
fastsemsim/ontology/CellOntology.py
fastsemsim/ontology/DiseaseOntology.py
fastsemsim/ontology/FFOntology.py
fastsemsim/ontology/GeneOntology.py
fastsemsim/ontology/Ontology.py
fastsemsim/ontology/__init__.py
fastsemsim/ontology/_libs.py
fastsemsim/semsim/BMASemSim.py
fastsemsim/semsim/CosineSemSim.py
fastsemsim/semsim/CzekanowskiDiceSemSim.py
fastsemsim/semsim/DiceSemSim.py
fastsemsim/semsim/GSESAMESemSim.py
fastsemsim/semsim/JaccardSemSim.py
fastsemsim/semsim/JiangConrathSemSim.py
fastsemsim/semsim/LinSemSim.py
fastsemsim/semsim/MixSemSim.py
fastsemsim/semsim/ObjSemSim.py
fastsemsim/semsim/ObjSetSemSim.py
fastsemsim/semsim/ResnikSemSim.py
fastsemsim/semsim/SemSimUtils.py
fastsemsim/semsim/SetSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimGICSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimICNDSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimICNPSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimICSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimNTOSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimRelSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimTOSemSim.py
fastsemsim/semsim/SimUISemSim.py
fastsemsim/semsim/TermSemSim.py
fastsemsim/semsim/__init__.py
fastsemsim/semsim/_libs.py
fastsemsim/semsim/avgSemSim.py
fastsemsim/semsim/maxSemSim.py